MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 22155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021881	CTG	2	6	247445	247450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464240
4002	NC_021881	GAACG	2	10	247551	247560	40 %	0 %	40 %	20 %	526464240
4003	NC_021881	CTA	2	6	247564	247569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
4004	NC_021881	T	6	6	247662	247667	0 %	100 %	0 %	0 %	526464240
4005	NC_021881	CTA	2	6	247688	247693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
4006	NC_021881	GTA	2	6	247710	247715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464240
4007	NC_021881	CTT	2	6	247754	247759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464240
4008	NC_021881	TA	4	8	247782	247789	50 %	50 %	0 %	0 %	526464240
4009	NC_021881	CAT	2	6	247832	247837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
4010	NC_021881	TCA	2	6	247846	247851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
4011	NC_021881	GAC	2	6	247900	247905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464240
4012	NC_021881	AAG	2	6	247955	247960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464240
4013	NC_021881	GTT	2	6	248039	248044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464240
4014	NC_021881	AAC	2	6	248062	248067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464240
4015	NC_021881	TCT	2	6	248086	248091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464240
4016	NC_021881	AGC	2	6	248205	248210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464240
4017	NC_021881	ATT	2	6	248326	248331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464240
4018	NC_021881	GCT	2	6	248345	248350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464240
4019	NC_021881	CA	3	6	248370	248375	50 %	0 %	0 %	50 %	526464240
4020	NC_021881	TAT	2	6	248427	248432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464240
4021	NC_021881	CATA	2	8	248501	248508	50 %	25 %	0 %	25 %	526464240
4022	NC_021881	TA	3	6	248555	248560	50 %	50 %	0 %	0 %	526464240
4023	NC_021881	TCC	2	6	248590	248595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464240
4024	NC_021881	CAGC	2	8	248624	248631	25 %	0 %	25 %	50 %	526464240
4025	NC_021881	TCT	2	6	248671	248676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464240
4026	NC_021881	ATG	2	6	248722	248727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464240
4027	NC_021881	TGT	2	6	248737	248742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464240
4028	NC_021881	TACT	2	8	248786	248793	25 %	50 %	0 %	25 %	526464240
4029	NC_021881	ATC	2	6	248815	248820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
4030	NC_021881	TA	3	6	248855	248860	50 %	50 %	0 %	0 %	526464240
4031	NC_021881	GT	3	6	249128	249133	0 %	50 %	50 %	0 %	526464240
4032	NC_021881	AAC	2	6	249231	249236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464240
4033	NC_021881	TCC	2	6	249282	249287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464240
4034	NC_021881	TC	3	6	249304	249309	0 %	50 %	0 %	50 %	526464240
4035	NC_021881	T	6	6	249335	249340	0 %	100 %	0 %	0 %	526464240
4036	NC_021881	TTC	2	6	249345	249350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464240
4037	NC_021881	CAC	2	6	249432	249437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464240
4038	NC_021881	CTG	2	6	249551	249556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464240
4039	NC_021881	GTA	2	6	249574	249579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464240
4040	NC_021881	GCC	2	6	249585	249590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464240
4041	NC_021881	TA	3	6	249639	249644	50 %	50 %	0 %	0 %	526464240
4042	NC_021881	TCT	2	6	249742	249747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464240
4043	NC_021881	ATC	2	6	249778	249783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
4044	NC_021881	C	6	6	249849	249854	0 %	0 %	0 %	100 %	526464240
4045	NC_021881	AT	3	6	249928	249933	50 %	50 %	0 %	0 %	526464240
4046	NC_021881	GTCA	2	8	249954	249961	25 %	25 %	25 %	25 %	526464240
4047	NC_021881	TAG	2	6	249965	249970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464240
4048	NC_021881	AGT	2	6	250040	250045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464240
4049	NC_021881	AG	3	6	251091	251096	50 %	0 %	50 %	0 %	526464812
4050	NC_021881	CAAG	2	8	251701	251708	50 %	0 %	25 %	25 %	526464241
4051	NC_021881	GATA	2	8	251720	251727	50 %	25 %	25 %	0 %	526464241
4052	NC_021881	TGT	3	9	251769	251777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464241
4053	NC_021881	T	7	7	251888	251894	0 %	100 %	0 %	0 %	526464241
4054	NC_021881	TAT	2	6	252029	252034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464241
4055	NC_021881	GTG	2	6	252098	252103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464241
4056	NC_021881	ATA	2	6	252105	252110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464241
4057	NC_021881	TGC	2	6	252128	252133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464241
4058	NC_021881	AGA	2	6	252159	252164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464241
4059	NC_021881	AGCT	2	8	252203	252210	25 %	25 %	25 %	25 %	526464241
4060	NC_021881	CCT	2	6	252289	252294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464241
4061	NC_021881	TTC	3	9	252308	252316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464241
4062	NC_021881	ATCA	2	8	252362	252369	50 %	25 %	0 %	25 %	526464241
4063	NC_021881	GCA	2	6	252411	252416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464241
4064	NC_021881	CAA	2	6	252475	252480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464241
4065	NC_021881	CAG	2	6	252493	252498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464241
4066	NC_021881	A	7	7	252523	252529	100 %	0 %	0 %	0 %	526464242
4067	NC_021881	TAC	2	6	252624	252629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464242
4068	NC_021881	AAG	2	6	252654	252659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464242
4069	NC_021881	ATT	2	6	252667	252672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464242
4070	NC_021881	ACA	2	6	252680	252685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464242
4071	NC_021881	A	7	7	252879	252885	100 %	0 %	0 %	0 %	526464243
4072	NC_021881	TTCC	2	8	252972	252979	0 %	50 %	0 %	50 %	526464243
4073	NC_021881	TA	3	6	252982	252987	50 %	50 %	0 %	0 %	526464243
4074	NC_021881	ATT	2	6	253082	253087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464243
4075	NC_021881	CT	3	6	253100	253105	0 %	50 %	0 %	50 %	526464243
4076	NC_021881	GATA	2	8	253130	253137	50 %	25 %	25 %	0 %	526464243
4077	NC_021881	GTGC	2	8	253161	253168	0 %	25 %	50 %	25 %	526464243
4078	NC_021881	TTA	2	6	253213	253218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464243
4079	NC_021881	CAA	2	6	253393	253398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464243
4080	NC_021881	TAT	2	6	253679	253684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464243
4081	NC_021881	TGC	2	6	253750	253755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464243
4082	NC_021881	ATCGT	2	10	253769	253778	20 %	40 %	20 %	20 %	526464243
4083	NC_021881	TTA	2	6	253794	253799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464243
4084	NC_021881	AG	3	6	253859	253864	50 %	0 %	50 %	0 %	526464243
4085	NC_021881	T	6	6	253869	253874	0 %	100 %	0 %	0 %	526464243
4086	NC_021881	CCA	2	6	253897	253902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464243
4087	NC_021881	GTA	2	6	253920	253925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464243
4088	NC_021881	AAT	2	6	253946	253951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464243
4089	NC_021881	TGGA	2	8	254032	254039	25 %	25 %	50 %	0 %	526464243
4090	NC_021881	GAT	2	6	254144	254149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464243
4091	NC_021881	AGC	2	6	254180	254185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464243
4092	NC_021881	GAT	2	6	254207	254212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464243
4093	NC_021881	CAT	2	6	254240	254245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464243
4094	NC_021881	TGG	2	6	254270	254275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464243
4095	NC_021881	AGC	2	6	254404	254409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464243
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4098	NC_021881	TAAG	2	8	254524	254531	50 %	25 %	25 %	0 %	526464243
4099	NC_021881	CCT	2	6	254544	254549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464243
4100	NC_021881	CAG	2	6	254590	254595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464243
4101	NC_021881	GCG	2	6	254646	254651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464243
4102	NC_021881	GCA	2	6	254709	254714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464243
4103	NC_021881	GCG	2	6	254751	254756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464243
4104	NC_021881	AGT	2	6	254790	254795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464243
4105	NC_021881	CAG	2	6	254808	254813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464243
4106	NC_021881	AAT	2	6	254826	254831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464243
4107	NC_021881	CAT	2	6	254857	254862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464243
4108	NC_021881	GTT	2	6	254889	254894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464243
4109	NC_021881	CAG	2	6	254911	254916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464243
4110	NC_021881	GCA	3	9	254976	254984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464243
4111	NC_021881	GCG	2	6	255015	255020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464243
4112	NC_021881	TAGT	2	8	255049	255056	25 %	50 %	25 %	0 %	526464243
4113	NC_021881	CAG	2	6	255072	255077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464243
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4116	NC_021881	CAG	2	6	255148	255153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464243
4117	NC_021881	GCG	2	6	255177	255182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464243
4118	NC_021881	GGC	2	6	255242	255247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464243
4119	NC_021881	AGT	2	6	255264	255269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464243
4120	NC_021881	GCA	2	6	255319	255324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464243
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4122	NC_021881	AAT	2	6	255357	255362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464243
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4238	NC_021881	TCCAT	2	10	260963	260972	20 %	40 %	0 %	40 %	526464246
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4243	NC_021881	TGC	2	6	261255	261260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464246
4244	NC_021881	AGAAT	2	10	261261	261270	60 %	20 %	20 %	0 %	526464246
4245	NC_021881	ACA	2	6	261355	261360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464246
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4247	NC_021881	AGA	2	6	261474	261479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464246
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4250	NC_021881	GAAT	2	8	261548	261555	50 %	25 %	25 %	0 %	526464246
4251	NC_021881	GTT	2	6	261751	261756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464814
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4264	NC_021881	TGG	2	6	262677	262682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464248
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4353	NC_021881	CCCA	2	8	267411	267418	25 %	0 %	0 %	75 %	526464819
4354	NC_021881	AGT	2	6	267535	267540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464819
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4361	NC_021881	AGG	2	6	267946	267951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464820
4362	NC_021881	AG	3	6	267965	267970	50 %	0 %	50 %	0 %	526464820
4363	NC_021881	AAG	2	6	268074	268079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464820
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4365	NC_021881	ACTA	2	8	268752	268759	50 %	25 %	0 %	25 %	526464250
4366	NC_021881	ATC	2	6	268927	268932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464250
4367	NC_021881	TGC	2	6	268940	268945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464250
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4369	NC_021881	CT	3	6	268988	268993	0 %	50 %	0 %	50 %	526464250
4370	NC_021881	TTCT	2	8	269006	269013	0 %	75 %	0 %	25 %	526464250
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4374	NC_021881	TAC	2	6	269159	269164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464251
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4378	NC_021881	TC	3	6	269321	269326	0 %	50 %	0 %	50 %	526464251
4379	NC_021881	A	6	6	269342	269347	100 %	0 %	0 %	0 %	526464251
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4394	NC_021881	GATC	2	8	270224	270231	25 %	25 %	25 %	25 %	526464252
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4479	NC_021881	AG	4	8	274604	274611	50 %	0 %	50 %	0 %	526464255
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4487	NC_021881	AGA	2	6	274945	274950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464256
4488	NC_021881	TGG	2	6	275014	275019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464256
4489	NC_021881	T	6	6	275055	275060	0 %	100 %	0 %	0 %	526464256
4490	NC_021881	AGG	2	6	275064	275069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464256
4491	NC_021881	AAG	2	6	275109	275114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464256
4492	NC_021881	AG	3	6	275118	275123	50 %	0 %	50 %	0 %	526464256
4493	NC_021881	GATT	2	8	275149	275156	25 %	50 %	25 %	0 %	526464256
4494	NC_021881	CCTA	2	8	275159	275166	25 %	25 %	0 %	50 %	526464256
4495	NC_021881	GTT	2	6	275238	275243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464256
4496	NC_021881	GCA	2	6	275257	275262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464257
4497	NC_021881	ATAGG	2	10	275267	275276	40 %	20 %	40 %	0 %	526464257
4498	NC_021881	CTA	2	6	275318	275323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464257
4499	NC_021881	GGA	2	6	275358	275363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464257
4500	NC_021881	TGT	2	6	275370	275375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464257

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